Professore Ordinario di Zootecnia Generale e Miglioramento Genetico (AGRI 09/A) dal 2004. Ha conseguito la Laurea in Scienze Agrarie presso l'Università degli Studi di Napoli ed il Dottorato di Ricerca in Biotecnologie Molecolari presso l’Università degli Studi di Pavia. Dal 1992 è in servizio presso l'Università degli Studi del Molise prima come Ricercatore, poi come professore Associato ed infine come professore ordinario preso il Dipartimento di Scienze Agricoltura, Ambiente e Alimenti (DiAAA).

Ha svolto e svolge studi di caratterizzazione genetica e di valorizzazione della biodiversità zootecnica con particolare attenzione ai ruminanti, e studi sull'individuazione dei loci utili a migliorare le caratteristiche quanti-qualitative delle produzioni animali. Più recentemente ha condotto e sta conducendo, studi multidisciplinari sull'origine e la storia delle razze animali. Tutte le attività menzionate, , sono state realizzate nell'ambito di progetti in collaborazione, per i quali il professore Fabio Pilla sovente ha ricoperto il ruolo di coordinatore,  con gruppi di ricerca nazionali ed internazionali di chiara fama nel settore.

Ha tenuto e tiene diversi insegnamenti nell'ambito del corso di Scienze Agrarie con particolare riferimento al corso di Miglioramento Genetico. Nel corso della sua carriera ha messo a disposizione il suo impegno a vantaggio di numerose tematiche inerenti al territorio Molise, ponendosi da interlocutore tra le realtà aziendali e l’Università del Molise.

Dal 2002 al 2007 è stato delegato del Rettore per la Ricerca Scientifica. Dal 2009 al 2012 è stato presidente del Corso di Laurea in Scienze e Tecnologie Agrarie e dal 2013 al 2019 è stato Prorettore dell’Università degli Studi del Molise con delega per l’assegnazione dei fondi strutturali di Ateneo. Dal 2015 al 2019 è stato Presidente del Centro di ricerca per le risorse bioculturali e sviluppo locale, ruolo basilare inerente studi interdisciplinari riguardanti i territori del Molise. Nel biennio 2021-2023 è stato presidente della commissione per l'Abilitazione Scientifica Nazionale (ASN) per il settore concorsuale delle Scienze e Tecnologie Animali (07/G1).

Attualmente riveste l’incarico di Coordinatore dell’Unità di Gestione Qualità Ricerca (UGQ-R) per il Dipartimento di Agricoltura Ambiente e Alimenti (DiAAA) presso l’Università degli Studi del Molise. È membro di diverse associazioni Scientifiche ed Accademiche, tra le quali l'Associazione Scientifica di Produzioni Animali (ASPA), l'Accademia dei Georgofili, la European Federation of Animal Science (EAA) e l’International Society of Animal Genetics (ISAG). È componente quale esperto Tecnico-Scientifico dell’European Regional Focal Point per le risorse genetiche animali della FAO e del Comitato Nazionale Zootecnico del MASAF. È autore di oltre 127 pubblicazioni indicizzate su Scopus e revisore di numerose riviste scientifiche internazionali.